为适应与日俱增的妈祖信众朝圣的需求，1998年，祖庙又以妈祖石雕巨像为起点，沿着南轴线扩建一组长323米、宽99米的五进仿宋建筑群，更显其巍峨壮观，气派不凡。

    大牌坊：是进入南轴线第一幢建筑物，高19米，宽33米，五开间，是目前我国少见的雄伟牌坊之一。

    宫门：明永乐七年（1409），天妃庙升格为宫，御书赐额曰"弘仁普济天妃之宫"。兹据以摹勒为本宫之门额。门厅内祀千里眼、顺风耳二神将。据《封神演义》及民间传说，二将原为殷纣时的高明、高觉两兄弟，自封金王、柳王，为姜子牙所败。后化为妖，在湄洲西北方向作祟，遂被妈祖收伏为帐下二将。清同治八年（1869），由总理船政大臣沈葆桢题奏，赐封二神将为金将军、柳将军。

    钟鼓楼：塔型二层建筑，高15米，宽15米，长15米，内悬巨钟、大鼓。

    顺济殿：为本宫之前殿。宋宣和五年（1123），路允迪使高丽，中途震风，得神救助，回奏於朝，诏赐"顺济"庙额。兹以宋徽宗御书摹勒为本殿额名。殿内祀四海龙王，中间置"妈祖巡海图"巨型插屏。案：唐玄宗敕封四海之神，俗传即四海龙王。宋代以后，妈祖被奉为最高海神，四海龙王遂为其配祀之属神。

    天后广场：长120米，宽88米，祭坛和戏台面积达10000平方米，是祖庙举行盛大节庆和大型祭典的场所。

    正殿（敕封天后殿）：是南轴线主要建筑物，高19米，宽50米，进深30米，面积986平方米，可供千人同时朝拜，规模雄伟，气势磅礴。内供8米高妈祖座像。正殿题额曰"敕封天后宫"，系清康熙晋封妈祖为天后之后的统一名称。殿内主祀敕封天后之神金身，陪祀顺懿夫人（陈靖姑，又称临水夫人）和惠烈夫人（钱四娘）。另在两边配祀八位对弘扬妈祖功迹有独特建树的历史人物，即宋之路允迪、李富，元之蒲师文、宋本，明之郑和、林尧俞，清之姚启圣，施琅。

    灵慈殿：高15米，宽24米，进深15米，为本宫之后殿。额名"灵慈"，本为元文宗所赐，今用以彰妈祖灵应慈济之懿德。殿内主祀便装湄洲妈祖。据《陔余丛考》："徜遇风浪危急，呼妈祖则神披发而来，其效立应；若呼天妃，则神必冠帔而至，恐稽时刻。"又：两边二侍女手上之红灯和黄雀，为妈祖救海导航之主要象征物。

    妈祖文化园，有妈祖故事群雕、妈祖碑林、妈祖展览馆、摩崖题刻等、其独特的圣地风光和人文胜景，相得益彰，令天后懿德，熠熠生辉，骤然升华！